El objetivo general del grupo es el análisis de la diversidad de los hongos sobre la base del estudio de sus caracteres morfológicos, ecológicos y moleculares, con vistas a reconstruir las historias filogenéticas de los taxones y abordar así el estudio de algunos de los aspectos fundamentales que rigen su evolución y de los patrones que determinan su distribución, además de abordar cuestiones relacionadas con la conservación de la biodiversidad.

Además, otro de los objetivos es apoyar a las colecciones y centros españoles sobre biodiversidad, ya que uno de los miembros del grupo es desde 2009, el representante del nodo GBIF-ES (Global Biodiversity Information Facility), patrocinado por el Ministerio Español de Ciencia e Innovación y gestionado por el CSIC, y co-lidera la Plataforma Temática Interdisciplinar Ecobiodiv creada por el CSIC para la síntesis de datos de ecosistemas y biodiversidad.