Más allá de la batata: a la búsqueda de especies, rasgos y genomas en Ipomoea para nuevos cultivos sostenibles (IPOSTOR)
Datos generales
Proyecto liderado por el Real Jardín Botánico-CSIC en el que colabora la Universidad Complutense de Madrid, el Institut Botànic de Barcelona (IBB), la Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Perú, la Universidad Nacional Autónoma de México, la Universidad de Oxford y el Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC).
Proyecto financiado a través de la convocatoria de ayudas 2021 a Proyectos estratégicos orientados a la transición ecológica y a la transición digital, del Plan Estatal de Investigación Científica, Técnica y de Innovación para el período 2021-2023, en el marco del Plan de Recuperación, Transformación y Resiliencia.
Introducción
La batata, Ipomoea batatas(L.) Lam., es uno de los cultivos más consumidos a nivel mundial. Cultivada en todas las regiones tropicales y subtropicales por sus raíces de almacenamiento comestibles, I. batatas es la especie más conocida del género Ipomoea (Convolvulaceae), aunque no la única que desarrolla raíces de almacenamiento ni la única consumida por el ser humano. Al menos 80 especies americanas silvestres de Ipomoea han sido descritas con órganos subterráneos de reserva, algunos de ellos de tamaño comparable y también comestibles. Este proyecto integra análisis genómicos y transcriptómicos con el estudio de colecciones de herbario y bases de datos globales de biodiversidad con el fin de investigar el desarrollo y la evolución de las raíces de almacenamiento en Ipomoea.
Objetivo principal del proyecto
Este proyecto integra análisis genómicos y transcriptómicos con el estudio de colecciones de herbario y bases de datos globales de biodiversidad con el fin de investigar el desarrollo y la evolución de las raíces de almacenamiento en Ipomoea.
En particular, los objetivos son:
- Evaluar si las especies silvestres de Ipomoea con raíces comestibles presentan rasgos de interés para la mejora de la batata , como resistencia a patógenos o adaptabilidad a condiciones ambientales cambiantes.
- Generar un marco evolutivo robusto para estudiar el origen y la evolución de las raíces de almacenamiento en Ipomoea.
Paquetes de trabajo
Objetivo 1:
- Tarea 1. Recolección de material biológico
- Tarea 2. Extracción de ADN y secuenciación de alto rendimiento
- Tarea 3. Estimación del tamaño del genoma y nivel de ploidía
- Tarea 4. Estudio anatómico, del desarrollo e histoquímico de las raíces de Ipomoea
- Tarea 5. Análisis estructurales del genoma
- Tarea 6. Análisis transcriptómicos
Objetivo 2:
- Tarea 10. Filogenias calibradas en el tiempo y análisis de la evolución de caracteres.
- Tarea 7. Ensamblaje de genomas nucleares y del genoma completo del cloroplasto para análisis filogenéticos
- Tarea 8. Análisis filogenómicos
- Tarea 9. Datos de distribución y elaboración de mapas
Principales resultados esperados
- Identificación de nuevas especies para uso potencial alimentario.
- Muestreo y ensamblaje de nuevos genomas, plastomas y transcriptomas de especies de Ipomoea.
- Descubrimiento de rasgos del desarrollo de los tubérculos y su base genética
- Aclaración del papel de la poliploidía en el desarrollo de los tubérculos de Ipomoea.
- Generación de un nuevo marco filogenético datado del linaje americano de Ipomoea incluyendo en él nuevas especies.
Enlace de interés: http://hdl.handle.net/10261/426663
Proyecto con referencia TED2021-129270B-I00, financiado por MCIN/AEI/10.13039/501100011033 y por la Unión Europea “NextGenerationEU”/PRTR.
